Synopsis :

L'histoire met en scène une guerre aux 4 coins du monde entre le G.I. Joe (un groupe de soldats d'élites sous commandement Américain), appelés aussi Héros Sans Frontières, à une organisation terroriste internationale (fictive), appelée Cobra.

Dans chaque épisode, quelques membres du G.I. Joe affrontent quelques membres de Cobra dans un nouveau scénario (pour un objet précieux, de l'argent, une nouvelle arme, etc.). Dans quelques épisodes (les mini-séries principalement), Cobra tente de dominer le monde entier, et on retrouve presque tous les personnages du G.I Joe et de Cobra.